Titolo: Advancing Development of Synthetic Gene Regulators: With the Power of High-throughput Sequencing in Chemical Biology
Editore: Springer Verlag
Data di pubblicazione: 2017
Lingua: Inglese
ISBN 10: 9811065462
ISBN 13: 9789811065460
Rilegatura: Hardcover
Condizione: Brand New
Peso: 0,36 chilogrammi

Descrizione articolo

Riassunto

This book focuses on an �outside the box� notion by utilizing the powerful applications of next-generation sequencing (NGS) technologies in the interface of chemistry and biology. In personalized medicine, developing small molecules targeting a specific genomic sequence is an attractive goal. N-methylpyrrole (P)�N-methylimidazole (I) polyamides (PIPs) are a class of small molecule that can bind to the DNA minor groove. First, a cost-effective NGS (ion torrent platform)-based Bind-n-Seq was developed to identify the binding specificity of PIP conjugates in a randomized DNA library. Their biological influences rely primarily on selective DNA binding affinity, so it is important to analyze their genome-wide binding preferences. However, it is demanding to enrich specifically the small-molecule-bound DNA without chemical cross-linking or covalent binding in chromatinized genomes. Herein is described a method that was developed using high-throughput sequencing to map the differential binding sites and relative enriched regions of non-cross-linked SAHA-PIPs throughout the complex human genome. SAHA-PIPs binding motifs were identified and the genome-level mapping of SAHA-PIPs-enriched regions provided evidence for the differential activation of the gene network. A method using high-throughput sequencing to map the binding sites and relative enriched regions of alkylating PIP throughout the human genome was also developed. The genome-level mapping of alkylating the PIP-enriched region and the binding sites on the human genome identifies significant genomic targets of breast cancer. It is anticipated that this pioneering low-cost, high through-put investigation at the sequence-specific level will be helpful in understanding the binding specificity of various DNA-binding small molecules, which in turn will be beneficial for the development of small-molecule-based drugs targeting a genome-level sequence.

Dalla quarta di copertina

This book focuses on an outside the box notion by utilizing the powerful applications of next-generation sequencing (NGS) technologies in the interface of chemistry and biology. In personalized medicine, developing small molecules targeting a specific genomic sequence is an attractive goal. N-methylpyrrole (P) N-methylimidazole (I) polyamides (PIPs) are a class of small molecule that can bind to the DNA minor groove. First, a cost-effective NGS (ion torrent platform)-based Bind-n-Seq was developed to identify the binding specificity of PIP conjugates in a randomized DNA library. Their biological influences rely primarily on selective DNA binding affinity, so it is important to analyze their genome-wide binding preferences. However, it is demanding to enrich specifically the small-molecule-bound DNA without chemical cross-linking or covalent binding in chromatinized genomes. Herein is described a method that was developed using high-throughput sequencing to map the differential binding sites and relative enriched regions of non-cross-linked SAHA-PIPs throughout the complex human genome. SAHA-PIPs binding motifs were identified and the genome-level mapping of SAHA-PIPs-enriched regions provided evidence for the differential activation of the gene network. A method using high-throughput sequencing to map the binding sites and relative enriched regions of alkylating PIP throughout the human genome was also developed. The genome-level mapping of alkylating the PIP-enriched region and the binding sites on the human genome identifies significant genomic targets of breast cancer. It is anticipated that this pioneering low-cost, high through-put investigation at the sequence-specific level will be helpful in understanding the binding specificity of various DNA-binding small molecules, which in turn will be beneficial for the development of small-molecule-based drugs targeting a genome-level sequence.

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Diritto di recesso

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Il periodo di recesso scade dopo 14 giorni dal giorno in cui

tu acquisisci, o un terzo designato diverso dal vettore e da te acquisisce, il possesso fisico dell'ultimo bene o l'ultimo lotto o pezzo.

Per esercitare il diritto di recesso, sei tenuto a informare Revaluation Books, Exstowe, Exton, EX3 0PP, Exeter, United Kingdom, 44 1179083586, della tua decisione di recedere dal presente contratto tramite una dichiarazione esplicita (ad esempio lettera inviata per posta, fax o posta elettronica). A tal fine puoi utilizzare il modulo tipo di recesso, ma non e' obbligatorio. Puoi anche compilare e inviare elettronicamente il modulo tipo di recesso o qualsiasi altra esplicita dichiarazione sul nostro sito web, dalla sezione "Ordini" nel "Mio Account". Nel caso scegliessi questa opzione, ti trasmetteremo senza indugio una conferma di ricevimento su un supporto durevole (ad esempio per posta elettronica).

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