The increasing availability of molecular and genetic databases coupled with the growing power of computers gives biologists opportunities to address new issues, such as the patterns of molecular evolution, and re-assess old ones, such as the role of adaptation in species diversification.

In the second edition, the book continues to integrate a wide variety of data analysis methods into a single and flexible interface: the R language. This open source language is available for a wide range of computer systems and has been adopted as a computational environment by many authors of statistical software. Adopting R as a main tool for phylogenetic analyses will ease the workflow in biologists' data analyses, ensure greater scientific repeatability, and enhance the exchange of ideas and methodological developments. The second edition is completed updated, covering the full gamut of R packages for this area that have been introduced to the market since its previous publication five years ago. There is also a new chapter on the simulation of evolutionary data.

Graduate students and researchers in evolutionary biology can use this book as a reference for data analyses, whereas researchers in bioinformatics interested in evolutionary analyses will learn how to implement these methods in R. The book starts with a presentation of different R packages and gives a short introduction to R for phylogeneticists unfamiliar with this language. The basic phylogenetic topics are covered: manipulation of phylogenetic data, phylogeny estimation, tree drawing, phylogenetic comparative methods, and estimation of ancestral characters. The chapter on tree drawing uses R's powerful graphical environment. A section deals with the analysis of diversification with phylogenies, one of the author's favorite research topics. The last chapter is devoted to the development of phylogenetic methods with R and interfaces with otherlanguages (C and C++). Some exercises conclude these chapters.

Informazioni sull?autore

Emmanuel Paradis is an evolutionary biologist at the Institut de Recherche pour le D�veloppement (IRD) in Montpellier and Jakarta. He received his Doctorate Diploma in population biology and ecology in 1993 at the University of Montpellier II. He has conducted empirical and theoretical research on birds, mammals, and fish. He worked at the British Trust for Ornithology for three years and at the Institut des Sciences de l'�volution in Montpellier for seven years where he developed most of the ideas presented in this book. He is the main author and maintainer of the R packages APE (Analysis of Phylogenetics and Evolution) and PEGAS (Population and Evolutionary Genetics Analysis System).

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Diritto di recesso

Se sei un consumatore, puoi esercitare il tuo diritto di recesso seguendo le istruzioni riportate di seguito. Per "consumatore" si intende qualsiasi persona fisica che agisca per fini che non rientrano nel quadro della sua attivit� commerciale, industriale, artigianale o professionale.

Informazioni relative al diritto di recesso

Diritto di recesso

Hai il diritto di recedere dal presente contratto, senza indicarne le ragioni, entro 14 giorni.

Il periodo di recesso scade dopo 14 giorni dal giorno in cui

tu acquisisci, o un terzo designato diverso dal vettore e da te acquisisce, il possesso fisico dell'ultimo bene o l'ultimo lotto o pezzo.

Per esercitare il diritto di recesso, sei tenuto a informare Revaluation Books, Exstowe, Exton, EX3 0PP, Exeter, United Kingdom, 44 1179083586, della tua decisione di recedere dal presente contratto tramite una dichiarazione esplicita (ad esempio lettera inviata per posta, fax o posta elettronica). A tal fine puoi utilizzare il modulo tipo di recesso, ma non e' obbligatorio. Puoi anche compilare e inviare elettronicamente il modulo tipo di recesso o qualsiasi altra esplicita dichiarazione sul nostro sito web, dalla sezione "Ordini" nel "Mio Account". Nel caso scegliessi questa opzione, ti trasmetteremo senza indugio una conferma di ricevimento su un supporto durevole (ad esempio per posta elettronica).

Per rispettare il termine di recesso, � sufficiente inviare la comunicazione relativa all'esercizio del diritto di recesso prima della scadenza del periodo di recesso.

Effetti del recesso

Se recedi dal presente contratto, ti saranno rimborsati tutti i pagamenti che hai effettuato a nostro favore, compresi i costi di consegna (ad eccezione dei costi supplementari derivanti dalla tua eventuale scelta di un tipo di consegna diverso dal tipo meno costoso di consegna standard da noi offerto). Potremo trattenere dal rimborso le somme derivanti da una diminuzione del valore del prodotto risultante da una tua non necessaria manipolazione.

I rimborsi verranno effettuati senza indebito ritardo e in ogni caso non oltre 14 giorni dal giorno in cui siamo stati informati della tua decisione di recedere dal presente contratto.

Detti rimborsi saranno effettuati utilizzando lo stesso mezzo di pagamento da te usato per la transazione iniziale, salvo che tu non abbia espressamente convenuto altrimenti; in ogni caso, non dovrai sostenere alcun costo quale conseguenza di tale rimborso. Il rimborso pu� essere sospeso fino al ricevimento dei beni oppure fino all'avvenuta dimostrazione da parte tua di aver rispedito i beni, se precedente.

Ti preghiamo di rispedire i beni o di consegnarli a Revaluation Books, Edward Bowditch Ltd, Clifton Heights, Triangle West, BS8 1EJ, Bristol, United Kingdom, 44 1179083586, senza indebiti ritardi e in ogni caso entro 14 giorni dal giorno in cui hai comunicato il tuo recesso dal presente contratto. Il termine � rispettato se rispedisci i beni prima della scadenza del periodo di 14 giorni. I costi diretti della restituzione dei beni saranno a tuo carico. Sei responsabile solo della diminuzione del valore dei beni risultante da una manipolazione del bene diversa da quella necessaria per stabilire la natura, le caratteristiche e il funzionamento dei beni.

Eccezioni al diritto di recesso

Il diritto di recesso non si applica in caso di:

fornitura di giornali, periodici e riviste ad eccezione dei contratti di abbonamento per la fornitura di tali pubblicazioni;
fornitura di contenuto digitale (inclusi applicazioni, software, ebook, MP3, ecc.) mediante un supporto non materiale (per esempio un CD o un DVD) se al momento dell'inoltro dell'ordine hai espressamente consentito all'inizio dell'esecuzione accettando la perdita del diritto di recesso in conseguenza dell'inizio di esecuzione.

Modulo di recesso tipo

(Compilare e restituire il presente modulo solo se si desidera recedere dal contratto)

Destinatario: (Revaluation Books, Exstowe, Exton, EX3 0PP, Exeter, United Kingdom, 44 1179083586)

Con la presente io/noi (*) notifichiamo il recesso dal mio/nostro (*) contratto di vendita dei seguenti beni/servizi (*)

Ordinato il (*) /ricevuto il (*)

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