R Bioinformatics Cookbook: Utilize R packages for bioinformatics, genomics, data science, and machine learning
Lingua: inglese
Editore: Packt Publishing Limited, 2023
- Brossura
- Nuovo

Da: THE SAINT BOOKSTORE, Southport, Regno UnitoTHE SAINT BOOKSTORE
Venditore AbeBooks dal 14 giugno 2006
Condizione: Nuovo
EUR 51,66
Quantità: Più di 20 disponibili
Aggiungi al carrelloDescrizione dell’articolo da parte del venditore
This item is printed on demand. New copy - Usually dispatched within 5-9 working days.
Codice articolo C9781837634279
- Titolo
- R Bioinformatics Cookbook: Utilize R packages for bioinformatics, genomics, data science, and machine learning
- Autore
- Dan MacLean
- Editore
- Packt Publishing Limited
- Anno di pubblicazione
- 2023
- Condizione
- New
- Rilegatura
- Paperback / softback
- Lingua
- inglese
- ISBN 10
- 1837634270
- ISBN 13
- 9781837634279
- Edizione
- seconda edizione
- Peso dell'articolo
- 526 grammi
Discover over 80 recipes for modeling and handling real-life biological data using modern libraries from the R ecosystem
Key Features
- Apply modern R packages to process biological data using real-world examples
- Represent biological data with advanced visualizations and workflows suitable for research and publications
- Solve real-world bioinformatics problems such as transcriptomics, genomics, and phylogenetics
- Purchase of the print or Kindle book includes a free PDF eBook
Book Description
The updated second edition of R Bioinformatics Cookbook takes a recipe-based approach to show you how to conduct practical research and analysis in computational biology with R. You’ll learn how to create a useful and modular R working environment, along with loading, cleaning, and analyzing data using the most up-to-date Bioconductor, ggplot2, and tidyverse tools.
This book will walk you through the Bioconductor tools necessary for you to understand and carry out protocols in RNA-seq and ChIP-seq, phylogenetics, genomics, gene search, gene annotation, statistical analysis, and sequence analysis. As you advance, you'll find out how to use Quarto to create data-rich reports, presentations, and websites, as well as get a clear understanding of how machine learning techniques can be applied in the bioinformatics domain. The concluding chapters will help you develop proficiency in key skills, such as gene annotation analysis and functional programming in purrr and base R. Finally, you'll discover how to use the latest AI tools, including ChatGPT, to generate, edit, and understand R code and draft workflows for complex analyses.
By the end of this book, you'll have gained a solid understanding of the skills and techniques needed to become a bioinformatics specialist and efficiently work with large and complex bioinformatics datasets.
What you will learn
- Set up a working environment for bioinformatics analysis with R
- Import, clean, and organize bioinformatics data using tidyr
- Create publication-quality plots, reports, and presentations using ggplot2 and Quarto
- Analyze RNA-seq, ChIP-seq, genomics, and next-generation genetics with Bioconductor
- Search for genes and proteins by performing phylogenetics and gene annotation
- Apply ML techniques to bioinformatics data using mlr3
- Streamline programmatic work using iterators and functional tools in the base R and purrr packages
- Use ChatGPT to create, annotate, and debug code and workflows
Who This Book Is For
This book is for bioinformaticians, data analysts, researchers, and R developers who want to address intermediate-to-advanced biological and bioinformatics problems by learning via a recipe-based approach. Working knowledge of the R programming language and basic knowledge of bioinformatics are prerequisites.
Table of Contents
- Setting Up Your R Bioinformatics Working Environment
- Loading, Tidying, and Cleaning Data in the tidyverse
- ggplot2 and Extensions for Publication Quality Plots
- Using Quarto to Make Data-Rich Reports, Presentations, and Websites
- Easily Performing Statistical Tests Using Linear Models
- Performing Quantitative RNA-seq
- Finding Genetic Variants with HTS Data
- Searching Gene and Protein Sequences for Domains and Motifs
- Phylogenetic Analysis and Visualization
- Analyzing Gene Annotations
- Machine Learning with mlr3
- Functional Programming in puRRR and base R
- Turbo-Charging Development in R with ChatGPT
"Riassunto" può appartenere a un’altra edizione di questo titolo.
Informazioni sull’autore
"Descrizione articolo" può appartenere a un’altra edizione di questo titolo.
THE SAINT BOOKSTORE
Southport, Regno Unito
Venditore AbeBooks dal 14 giugno 2006
Tariffe di spedizione da Regno Unito a U.S.A.
| Articolo | Da 7 a 28 giorni lavorativi | Da 7 a 28 giorni lavorativi |
|---|---|---|
| Primo articolo | EUR 18,92 | EUR 21,28 |
Metodi di pagamento
Descrizione dello Store
The Saint Bookstore has a range of over 1 million titles available.
Specializzazione
GeneralInformazioni sull’azienda del venditore
SB ONLINE LTD
50 Devonshire Road
Southport, Regno Unito PR9 7BZ
Condizioni di vendita
Please order through the Abebooks checkout. We only take orders through Abebooks - We don't take direct orders by email or phone.
Refunds or Returns: A full refund of the purchase price will be given if returned within 30 days in undamaged condition.
As a seller on abebooks we adhere to the terms explained at http://www.abebooks.co.uk/docs/HelpCentral/buyerIndex.shtml - if you require further assistance please email us at orders@thesaintbookstore.co.uk
Diritto di recesso
Se sei un consumatore puoi recedere dal contratto in conformità con quanto segue. Per Consumatore si intende qualsiasi persona fisica che agisce per scopi estranei alla propria attività commerciale, imprenditoriale, artigianale o professionale.
Informazioni sul diritto di recesso
Diritto legale di recesso
Hai il diritto di recedere dal presente contratto entro 14 giorni senza fornire alcuna motivazione.
Il periodo di recesso scade dopo 14 giorni dal giorno in cui tu o una terza parte, diversa dal vettore e da te indicata, acquisisce il possesso fisico dell'ultimo bene o dell'ultimo lotto o pezzo.
Per esercitare il diritto di recesso, compila e invia elettronicamente una dichiarazione esplicita sul nostro sito Web, alla voce “I miei acquisti” nella sezione “Mio account”. Ti comunicheremo senza indugio una conferma di ricezione di tale recesso su un supporto durevole (ad es. via e-mail).
Per rispettare il termine di recesso, è sufficiente inviare la comunicazione relativa all'esercizio del diritto di recesso prima della scadenza del periodo di recesso stesso.
Effetti del recesso
In caso di recesso dal presente contratto, ti rimborseremo tutti i pagamenti ricevuti, compresi i costi di spedizione (ad eccezione dei costi supplementari derivanti dalla tua eventuale scelta di un tipo di spedizione diverso dal tipo meno costoso di consegna standard da noi offerto).
Potremo effettuare una detrazione dal rimborso per la perdita di valore dei beni forniti, qualora tale perdita sia il risultato di una manipolazione non necessaria da parte tua.
Eseguiremo il rimborso senza indebito ritardo e non oltre 14 giorni dal giorno in cui saremo informati della tua decisione di recedere dal presente contratto.
Il rimborso sarà effettuato utilizzando lo stesso mezzo di pagamento da te usato per la transazione iniziale, salvo che tu non abbia espressamente concordato altrimenti; in ogni caso, non dovrai sostenere alcun costo quale conseguenza di tale rimborso.
Possiamo trattenere il rimborso finché non avremo ricevuto i beni oppure finché non avrai fornito la prova di averli rispediti, a seconda di quale condizione si verifichi per prima.
Dovrai rispedire i beni o consegnarli a THE SAINT BOOKSTORE, Southport, United Kingdom, senza indebito ritardo e, in ogni caso, entro 14 giorni dal giorno in cui ci hai comunicato la tua volontà di recedere dal presente contratto. Il termine è rispettato se rispedisci i beni prima della scadenza del periodo di 14 giorni. I costi diretti della restituzione dei beni saranno a tuo carico. Sei responsabile solo della diminuzione del valore dei beni risultante da una manipolazione diversa da quella necessaria per stabilire la natura, le caratteristiche e il funzionamento dei beni stessi.
Eccezioni al diritto di recesso
Il diritto di recesso non si applica a:
- La fornitura di giornali, periodici o riviste ad eccezione dei contratti di abbonamento; e
- La fornitura di contenuto digitale non fornito su un supporto materiale (ad es. su un CD o DVD), se al momento dell'invio dell'ordine hai accettato l'inizio dell'esecuzione e hai riconosciuto che non avresti potuto recedere una volta iniziata l'esecuzione.
Condizioni di spedizione
Most orders usually ship within 1-3 business days, but some can take up to 7 days.