CHARACTERIZE MAMMALIAN TRANSCRIPTOME COMPLEXITY : FROM GENOME-WIDE RT-PCR CDNA CLONING, TO NOVEL MAMMALIAN GENE DISCOVERY, AND TRANSCRIPTOME COMPLEXITY
Lingua: inglese
Editore: LAP LAMBERT Academic Publishing, 2011
- Brossura
- Nuovo
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nach der Bestellung gedruckt Neuware - Printed after ordering - In my Ph.D. thesis, I described a large scale RT-PCR and cloning pipeline that I developed to obtain several thousand full-length mammalian (mainly human and mouse) cDNA clones for the NHGRI/NCI Mammalian Gene Collection effort. At that time, the layers of the mammalian transcriptome complexity were not yet fully conceived. In this project, I was deeply involved in strategic and conceptual issues in characterizing transcriptome complexity from different levels. Using the RT-PCR pipeline combined with gene prediction algorithms that utilize comparative genomic information, we successfully identified and experimentally verified novel mammalian genes such as full-length rat homologs of human disease genes. Furthermore, I studied transcriptome complexity including SNPs and alternative splicing in leukemia samples using quantitative PCR, and we developed a trace analysis technology to identify multiple alternative spliced transcripts in one single sequencing reaction. My results suggested that alternatively spliced transcripts show cancer type specific up- or down- regulation, and the ratio of alternative spliced isoforms may underlie the cancer mechanism.…
Codice articolo 9783844320602
- Titolo
- CHARACTERIZE MAMMALIAN TRANSCRIPTOME COMPLEXITY : FROM GENOME-WIDE RT-PCR CDNA CLONING, TO NOVEL MAMMALIAN GENE DISCOVERY, AND TRANSCRIPTOME COMPLEXITY
- Autore
- Jiaqian Wu
- Editore
- LAP LAMBERT Academic Publishing
- Anno di pubblicazione
- 2011
- Condizione
- Neu
- Rilegatura
- Taschenbuch
- Lingua
- inglese
- ISBN 10
- 3844320601
- ISBN 13
- 9783844320602
- Peso dell'articolo
- 322 grammi
- Dimensioni
- 220x150x13 mm
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