DNA Motif Discovery

Lingua: inglese

Editore: LAP LAMBERT Academic Publishing Mai 2013, 2013

3659392928 / 9783659392924

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This item is printed on demand - it takes 3-4 days longer - Neuware -Regulatory motifs are short patterns of nucleotides, usually 5-20 bp long, found common in the promoter region of set of co-expressed genes. Identification of these motifs gives insight into the regulatory mechanism of genes, as they control the expression or regulation of a group of genes involved in a similar cellular function. Motif discovery algorithms aim to discover these common patterns, which may present in either strand of the DNA double helix. Identification of DNA motifs is complex due to mutations, which make them weekly conserved patterns. This book describes two intelligent computing algorithms for discovering regulatory motifs. First algorithm, MotifMiner, is a table driven greedy algorithm. Even though it could identify meaningful motifs from the test dataset, due to greedy approach it may fall into local optimum. The second algorithm, AISMOTIF, is an artificial immune system based pattern discovery algorithm. The major advantage of this algorithm is its ability to generate all possible motifs in the input sequences simultaneously in reasonable time. This book is intended to research scholars in the areas of pattern matching and computational biology. 124 pp. Englisch.…

Codice articolo 9783659392924

Titolo
DNA Motif Discovery
Autore
Seeja K. R.
Editore
LAP LAMBERT Academic Publishing Mai 2013
Anno di pubblicazione
2013
Condizione
Neu
Rilegatura
Taschenbuch
Lingua
inglese
ISBN 10
3659392928
ISBN 13
9783659392924
Peso dell'articolo
203 grammi
Dimensioni
220x150x8 mm

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