Glycome Informatics : Methods and Applications
Lingua: inglese
Editore: Taylor & Francis Ltd Nov 2009, 2009
Serie: Libro 48 di 50 - Chapman & Hall/CRC Computational Biology Series
- Rilegato
- Nuovo
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Neuware - The four essential molecular building blocks of cells are collectively referred to as glycans. The development of informatics tools for glycobiology and glycomics research has increased in recent years. This book provides an understanding of the glycobiology field, existing glycome informatics methods, and current problems faced by researchers. It presents an overview of available database resources, algorithms, and techniques. The author also introduces the role of carbohydrates as the third class of information-containing biological macromolecules and explains the fundamental characteristics of carbohydrate structures, which require specific encoding schemata, and algorithmic developments.
Codice articolo 9781420083347
- Titolo
- Glycome Informatics : Methods and Applications
- Autore
- Kiyoko F. Aoki-Kinoshita
- Editore
- Taylor & Francis Ltd Nov 2009
- Anno di pubblicazione
- 2009
- Condizione
- Neu
- Rilegatura
- Buch
- Lingua
- inglese
- ISBN 10
- 1420083341
- ISBN 13
- 9781420083347
- Peso dell'articolo
- 498 grammi
- Dimensioni
- 242x156x19 mm
- Serie
- Libro 48 di 50: Chapman & Hall/CRC Computational Biology Series
A Focused, State-of-the-Art Overview of This Evolving Field
Presents Various Techniques for Glycoinformatics
The development and use of informatics tools and databases for glycobiology and glycomics research have increased considerably in recent years. In addition to accumulating well-structured glyco-related data, researchers have now developed semi-automated methods for the annotation of mass spectral data and algorithms for capturing patterns in glycan structure data. These techniques have enabled researchers to gain a better understanding of how these complex structures affect protein function and other biological processes, including cancer.
One of the few up-to-date books available in this important area, Glycome Informatics: Methods and Applications covers all known informatics methods pertaining to the study of glycans. It discusses the current status of carbohydrate databases, the latest analytical techniques, and the informatics needed for rapid progress in glycomics research.
Providing an overall understanding of glycobiology, this self-contained guide focuses on the development of glycome informatics methods and current problems faced by researchers. It explains how to implement informatics methods in glycobiology. The author includes the required background material on glycobiology as well as the mathematical concepts needed to understand advanced mining and algorithmic techniques. She also suggests project themes for readers looking to begin research in the field.
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Informazioni sull’autore
Kiyoko F. Aoki-Kinoshita simultaneously received her bachelor’s and master’sdegrees of science in computer science from Northwestern University in 1996, after which she received her doctorate in computer engineering from Northwestern in 1999 under Dr. D. T. Lee. She was employed at BioDiscovery, Inc. in Los Angeles, California as a senior software engineer before moving to Kyoto, Japan, to work as a post-doctoral researcher at the Bioinformatics Center, Institute of Chemical Research, Kyoto University, under Drs. Hiroshi Mamitsuka and Minoru Kanehisa. There, she developed various algorithmic and data mining methods for analyzing the glycan structure data that were accumulated in the KEGG GLYCAN database. Since then, she has joined the faculty in the Department of Bioinformatics, Faculty of Engineering, Soka University, in Tokyo, Japan and is now an associate professor teaching bioinformatics. She is also involved in several research projects pertaining to the understanding of glycan function based on their structure as well as the recognition patterns of glycan structures by other proteins and even viruses. She has also begun developing a Web resource called RINGS (Resource for INformatics of Glycomes at Soka) that is still in its infancy, but is intended to freely provide many of the informatics algorithms and methods described in this book over the Web such that scientists may utilize them easily.
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