Implementation of Genome Transposition in GRIMM

Lingua: inglese

Editore: LAP LAMBERT Academic Publishing, 2018

6139966736 / 9786139966738

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nach der Bestellung gedruckt Neuware - Printed after ordering - In Computational biology, genome rearrangement by transposition is an important problem. Genome evolution analysis by transpositions leads to a combinatorial optimization problem of sorting by transpositions. Though the status of the transposition distance problem was open, a non-trivial proof for the NP-completeness of the transposition median problem is given [2]. In this work, we utilize a 1.375-approximation algorithm for sorting by transpositions [16]. GRIMM is a tool for analyzing rearrangements in pairs of genomes, including unichromosomal and multichromosomal genomes, and signed and unsigned data. In GRIMM, reversal is the only operation for unichromosomal genome rearrangement. In this book, we implement transposition in GRIMM as another unichromosomal operation.

Codice articolo 9786139966738

Titolo
Implementation of Genome Transposition in GRIMM
Autore
Saroar Ahmed
Editore
LAP LAMBERT Academic Publishing
Anno di pubblicazione
2018
Condizione
Neu
Rilegatura
Taschenbuch
Lingua
inglese
ISBN 10
6139966736
ISBN 13
9786139966738
Peso dell'articolo
107 grammi
Dimensioni
220x150x5 mm

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